RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 RETP07949 1114 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SLFN14P0C7P3 912 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PFKFB1P16118 471 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 GAP43P17677 238 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LAG3P18627 525 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RFX1P22670 979 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 EFNA5P52803 228 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NPEPPSP55786 919 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 GRIN1Q05586 938 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 POU5F1BQ06416 359 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC6Q16204 474 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TSSK4Q6SA08 328 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PDILTQ8N807 584 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NLRP7Q8WX94 980 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PNMA5Q96PV4 448 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PADI3Q9ULW8 664 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 IRAK3Q9Y616 596 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NOTCH4Q99466 2003 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 COL4A2P08572 1712 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GVL5 298 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ANHXE9PGG2 379 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 HAX1O00165 279 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 GPR182O15218 404 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 STBD1O95210 358 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KIF20AO95235 890 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KCNK5O95279 499 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SMC2O95347 1197 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KCNA4P22459 653 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PBX3P40426 434 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NAMPTP43490 491 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CLCN3P51790 818 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SLC12A3P55017 1021 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ALCAMQ13740 583 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LPAL2Q16609 132 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TMC7Q7Z402 723 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DEPTORQ8TB45 409 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ADAM32Q8TC27 787 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CLDN23Q96B33 292 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TIGD1Q96MW7 591 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PLIN2Q99541 437 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PARVGQ9HBI0 331 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RNF19AQ9NV58 838 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RMND1Q9NWS8 449 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 HPSEQ9Y251 543 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 C9IYK1 514 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ERLIN2O94905 339 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF202O95125 648 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PAPLNO95428 1278 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MCM4P33991 863 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFA8P51970 172 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 STRN3Q13033 797 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PAK2Q13177 524 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 FZD5Q13467 585 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 HTR4Q13639 388 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MCM6Q14566 821 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PTPN14Q15678 1187 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ECM1Q16610 540 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 USP49Q70CQ1 688 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms