RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989		H0YCG3	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989		K7ENM7	598 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLUD1	P00367	558 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MCF2	P10911	925 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDIT3	P35638	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TXLNA	P40222	546 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLCNKB	P51801	687 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	NAB2	Q15742	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24	3e-6	■■■■■ 156.3
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLDN3	O15551	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRAK2	O60296	914 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TOM1L1	O75674	476 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	B3GAT3	O94766	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PROZ	P22891	400 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	LIG4	P49917	911 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	STK38	Q15208	465 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989		I3L4J1	428 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ABLIM1	O14639	778 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CREM	Q03060	361 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSMD5	Q16401	504 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	UROC1	Q96N76	676 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TGM5	O43548	720 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	RFPL2	O75678	378 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	BRD1	O95696	1058 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	NBL1	P41271	181 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	BRCC3	P46736	316 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPAG1	Q07617	926 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	UPP1	Q16831	310 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PODXL	O00592	558 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNE1	P15382	129 aa		13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms