RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590977.5

EFTUD2-219, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 2,422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-219ENST00000590977 SOCS7O14512 581 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ANP32DO95626 131 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 KRT14P02533 472 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 OATP04181 439 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 TCP1P17987 556 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 GALCP54803 685 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 BLMHQ13867 455 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 CCDC38Q502W7 563 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 KCTD16Q68DU8 428 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 MCPH1Q8NEM0 835 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 SLC20A1Q8WUM9 679 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 CCT6BQ92526 530 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 HVCN1Q96D96 273 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 SEC16BQ96JE7 1060 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 FGD4Q96M96 766 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 C17orf75Q9HAS0 396 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 TAS2R14Q9NYV8 317 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 FBXO40Q9UH90 709 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 CFAP73A6NFT4 308 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 A6NHS1 94 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 CXCL11O14625 94 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 H2AFZP0C0S5 128 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 EPHX2P34913 555 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 KIF22Q14807 665 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 LY6KQ17RY6 165 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 H2AFVQ71UI9 128 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 SPATA4Q8NEY3 305 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ZFAND2BQ8WV99 257 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 POMGNT1Q8WZA1 660 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 OPTNQ96CV9 577 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 KCNH4Q9UQ05 1017 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 P4HA2O15460 535 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ARIH2O95376 493 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 PAEPP09466 180 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 GLRA2P23416 452 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ANXA13P27216 316 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 GJA5P36382 358 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 MXI1P50539 228 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 RTP1P59025 263 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 CCDC181Q5TID7 509 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 VPS36Q86VN1 386 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 IFT20Q8IY31 132 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 MFSD14AQ96MC6 490 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 FBXL18Q96ME1 805 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 KREMEN1Q96MU8 473 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ACP6Q9NPH0 428 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ALADP13716 330 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 WNT7BP56706 349 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 CYP24A1Q07973 514 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 TEX9Q8N6V9 391 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 TBC1D31Q96DN5 1066 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 BICD1Q96G01 975 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 IFT74Q96LB3 600 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 HAPLN2Q9GZV7 340 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ABLIM1O14639 778 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 GGPS1O95749 300 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 EDN1P05305 212 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ABCB4P21439 1286 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 TNFAIP3P21580 790 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ARL2P36404 184 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 PAK2Q13177 524 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 PPIL2Q13356 520 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 TAS1R2Q8TE23 839 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 ZNF570Q96NI8 536 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-219ENST00000590977 AGPAT1Q99943 283 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms