RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TATDN2Q93075 761 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 OSMRQ99650 979 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ASB7Q9H672 318 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A087X0T9 212 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT86O43790 486 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM228BP0C875 321 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 GRM5P41594 1212 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 GNG11P61952 73 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HTRA3P83110 453 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS36Q86VN1 386 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 KAT5Q92993 513 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ABL1P00519 1130 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF5AQ12840 1032 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF180Q86T96 592 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SERINC5Q86VE9 423 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CD302Q8IX05 232 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM84AQ96KN4 292 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAI1Q9UI46 699 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 INHAP05111 366 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCL8P10145 99 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 FGFR4P22455 802 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NCOA4Q13772 614 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NAB2Q15742 525 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NOTUMQ6P988 496 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM192Q8IY95 271 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF592Q92610 1267 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR24Q96S15 920 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIN2DO15399 1336 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LACTBL1A8MY62 500 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.527e-11■■■■■ 42.7
CAPNS1-207ENST00000589146 FANCGO15287 622 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PHACTR2O75167 634 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ASS1P00966 412 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNC2P02585 160 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 OSTNP61366 133 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 RSPH3Q86UC2 560 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ACAP3Q96P50 834 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NAGPAQ9UK23 515 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 INTUQ9ULD6 942 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP350Q5VT06 3117 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CASQ1P31415 396 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 LHX8Q68G74 356 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM212AQ96EL1 285 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 AGPAT1Q99943 283 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 GINS2Q9Y248 185 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 GRK4P32298 578 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CUL2Q13617 745 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF4BQ92750 862 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TFR2Q9UP52 801 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 DERAQ9Y315 318 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 C2CD2Q9Y426 696 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NPTXRO95502 500 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
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