RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 ADH1AP07327 375 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PLS3P13797 630 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PROZP22891 400 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 NCKAP1LP55160 1127 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 ZXDAP98168 799 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TUSC3Q13454 348 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 USP41Q3LFD5 358 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SPECC1Q5M775 1068 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR65Q8IYL9 337 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CALML4Q96GE6 196 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 B3GALT6Q96L58 329 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SPATA32Q96LK8 384 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PLIN2Q99541 437 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 REEP2Q9BRK0 252 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM9Q9C026 710 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 GDAQ9Y2T3 454 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC16A4O15374 487 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF4AO95239 1232 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 GLUD1P00367 558 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 C1RP00736 705 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SLFN14P0C7P3 912 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 EMP3P54852 163 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 GTF2BQ00403 316 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 MCM6Q14566 821 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PTPN21Q16825 1174 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR149Q86SP6 731 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 GPBP1Q86WP2 473 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CEP120Q8N960 986 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 HASPINQ8TF76 798 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CDT1Q9H211 546 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 FNIP2Q9P278 1114 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 DPP7Q9UHL4 492 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 USP25Q9UHP3 1055 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 USTQ9Y2C2 406 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 NOTCH4Q99466 2003 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM221A6NGB7 291 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 M0R296 226 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TGM5O43548 720 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 KLRC4O43908 158 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM189A1O60320 539 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 MYL1P05976 194 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 ADRB2P07550 413 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 SPATA31D3P0C874 917 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 MYBP10242 640 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PFKFB1P16118 471 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 PLA2G5P39877 138 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 TXLNAP40222 546 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-210ENST00000588340 GRM5P41594 1212 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms