RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 EXOC7Q9UPT5 735 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOXF2BP0C7M4 288 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 NPEPPSP55786 919 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 VSNL1P62760 191 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 PTK2Q05397 1052 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 CETN1Q12798 172 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF618Q5T7W0 954 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP2R2DQ66LE6 453 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOXF2Q9BQY4 288 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 TLR10Q9BXR5 811 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa27.48■■□□□ 1.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 MBTPS1Q14703 1052 aa27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 OTUD6AQ7L8S5 288 aa27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 ATP9AO75110 1047 aa27.46■■□□□ 1.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 DMTNQ08495 405 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-204ENST00000587718 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.46■■□□□ 1.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.45■■□□□ 1.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABCB6Q9NP58 842 aa27.45■■□□□ 1.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V0A1Q93050 837 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 APEX2Q9UBZ4 518 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa27.42■■□□□ 1.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 PALMO75781 387 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 TAP1Q03518 808 aa27.41■■□□□ 1.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC30A5Q8TAD4 765 aa27.41■■□□□ 1.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 SETD4Q9NVD3 440 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 PKD2L1Q9P0L9 805 aa27.41■■□□□ 1.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGFBP4P22692 258 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 THPOP40225 353 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 VAMP7P51809 220 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB103AP81534 67 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 MCPH1Q8NEM0 835 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 COG1Q8WTW3 980 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 PBKQ96KB5 322 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT11Q9BT88 431 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 DOCK5Q9H7D0 1870 aa27.4■■□□□ 1.98
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