RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585970.1

NEDD4L-213, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 487 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-213	ENST00000585970	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	MIER2	Q8N344	545 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	MYOC	Q99972	504 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	POGK	Q9P215	609 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	FAM20B	O75063	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	IL33	O95760	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ATP5J	P18859	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	MGAT1	P26572	445 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	RAP2B	P61225	183 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	NHLH2	Q02577	135 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	KAT5	Q92993	513 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	VPS11	Q9H270	941 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	TEX33	O43247	280 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	SGTA	O43765	313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ABLIM3	O94929	683 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	PDC	P20941	246 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	RAB27A	P51159	221 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NEDD4L-213	ENST00000585970	TRIM24	O15164	1050 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF185	O15231	689 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	AKAP10	O43572	662 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	RECQL4	O94761	1208 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	POMC	P01189	267 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	POU2F2	P09086	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	PF4V1	P10720	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	CHN2	P52757	468 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	CTXN1	P60606	82 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	DSC2	Q02487	901 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	MED25	Q71SY5	747 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEDD4L-213	ENST00000585970	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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