RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	27.08	■■□□□ 1.93
GPS1-223	ENST00000584229	GUCD1	Q96NT3	240 aa		27.08	■■□□□ 1.93
GPS1-223	ENST00000584229	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	27.08	■■□□□ 1.93
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		27.08	■■□□□ 1.93
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF233	A6NK53	670 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	GRM6	O15303	877 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	FOSL2	P15408	326 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CA8	P35219	290 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CEP135	Q66GS9	1140 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	HASPIN	Q8TF76	798 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	SZT2	Q5T011	3432 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	NFIC	P08651	508 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	PTMS	P20962	102 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	NR2F2	P24468	414 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R2	P41236	205 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	NAB2	Q15742	525 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	ADSSL1	Q8N142	457 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	POF1B	Q8WVV4	589 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	IGSF21	Q96ID5	467 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRO	Q16827	1216 aa		27.05	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		27.05	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	27.05	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	UROC1	Q96N76	676 aa		27.05	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	ASB7	Q9H672	318 aa		27.05	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		27.05	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229		F8W810	466 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	ADRB2	P07550	413 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	BMP6	P22004	513 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CLCNKB	P51801	687 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	BEST2	Q8NFU1	509 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CDH23	Q9H251	3354 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	PODXL	O00592	558 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	LPXN	O60711	386 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TADA2A	O75478	443 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	KIF4A	O95239	1232 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	GUCY2F	P51841	1108 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	NELFB	Q8WX92	580 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	FNBP1	Q96RU3	617 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	MARCH5	Q9NX47	278 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	DERA	Q9Y315	318 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	WNT7B	P56706	349 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	PLCB3	Q01970	1234 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	ADAM9	Q13443	819 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	ADGRE1	Q14246	886 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	SURF1	Q15526	300 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	FBXL18	Q96ME1	805 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	TLR9	Q9NR96	1032 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		27.02	■■□□□ 1.92
GPS1-223	ENST00000584229	B3GAT3	O94766	335 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	CCNE1	P24864	410 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJB1	P25685	340 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	CASP4	P49662	377 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	STX17	P56962	302 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	UBE3A	Q05086	875 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	CYP24A1	Q07973	514 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	27.01	■■□□□ 1.91
GPS1-223	ENST00000584229	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		27.01	■■□□□ 1.91

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