RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584216.5

COPS3-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 876 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-218ENST00000584216 ELF1P32519 619 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CCR3P51677 355 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MTAPQ13126 283 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CALCRLQ16602 461 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TSSK4Q6SA08 328 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 IRF7Q92985 503 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CHRDQ9H2X0 955 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 FZD8Q9H461 694 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 BRD9Q9H8M2 597 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 SNTG2Q9NY99 539 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PRRG1O14668 218 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MICAL2O94851 1124 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ADRB1P08588 477 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PTPN2P17706 415 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 NAB2Q15742 525 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PATJQ8NI35 1801 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PRKCBP05771 671 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 RETP07949 1114 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ATP2B1P20020 1258 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TGM1P22735 817 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 KRT2P35908 639 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PPP2R5AQ15172 486 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ST3GAL2Q16842 350 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ELMOD1Q8N336 334 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 DEPTORQ8TB45 409 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ARID2Q68CP9 1835 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ACKR2O00590 384 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 SLC30A4O14863 429 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 NEMFO60524 1076 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CEBPBP17676 345 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 NAMPTP43490 491 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 SPEM2Q0P670 501 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 FZD5Q13467 585 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 OXER1Q8TDS5 423 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 FAM3CQ92520 227 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MSANTD3Q96H12 275 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CORO1BQ9BR76 489 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 GDAQ9Y2T3 454 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CACNA1BQ00975 2339 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 H7C4K7 107 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 PSMC3P17980 439 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 CNR2P34972 360 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 TXKP42681 527 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 CLCNKBP51801 687 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 EFNA5P52803 228 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 SCRN1Q12765 414 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 UPP1Q16831 310 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 PPM1JQ5JR12 505 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 IQCEQ6IPM2 695 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 SKAP1Q86WV1 359 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 LEMD2Q8NC56 503 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 NACC1Q96RE7 527 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 COL4A3Q01955 1670 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 ABLIM3O94929 683 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 TDGF1P13385 188 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 ATF2P15336 505 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 LIG1P18858 919 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS3-218ENST00000584216 FCARP24071 287 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms