RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 FNTBP49356 437 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 CCT2P78371 535 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 SATB1Q01826 763 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 CYP4A11Q02928 519 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 SPIRE1Q08AE8 756 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 SLC5A9Q2M3M2 681 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 GALNT17Q6IS24 598 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 TPH2Q8IWU9 490 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 CORO1BQ9BR76 489 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 SNTG2Q9NY99 539 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 MTRRQ9UBK8 725 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 CDY1Q9Y6F8 540 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 PIAS3Q9Y6X2 628 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 CHD8Q9HCK8 2581 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-210ENST00000578916 CHD6Q8TD26 2715 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PTGESO14684 152 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF197O14709 1029 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 TBX3O15119 743 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 DGAT1O75907 488 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 DEXIO95424 95 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 BAG4O95429 457 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PSMC3P17980 439 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 FGFR3P22607 806 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 GLRA2P23416 452 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 FCARP24071 287 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PMLP29590 882 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 FAM78AQ5JUQ0 283 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 POTEHQ6S545 545 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ANKS3Q6ZW76 656 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 CEP68Q76N32 757 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 NEK8Q86SG6 692 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 LONP2Q86WA8 852 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 DAGLBQ8NCG7 672 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 TRPV5Q9NQA5 729 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 BACE2Q9Y5Z0 518 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 USP24Q9UPU5 2620 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ARHGEF37A1IGU5 675 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 LRRIQ4A6NIV6 560 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PRRG1O14668 218 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF263O14978 683 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 N4BP3O15049 544 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 TRAPPC3O43617 180 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 RECQL4O94761 1208 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 B3GAT3O94766 335 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 MICAL2O94851 1124 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 SLITRK3O94933 977 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 CHRNB1P11230 501 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 CCNE1P24864 410 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 SHC2P98077 582 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC32Q14392 662 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 CYP4A22Q5TCH4 519 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 FBXL16Q8N461 479 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 SPEM1Q8N4L4 309 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 HAS1Q92839 578 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 SMARCD2Q92925 531 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 TCEAL4Q96EI5 215 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ASB16Q96NS5 453 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ANKEF1Q9NU02 776 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 WDR27A2RRH5 827 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 CPLX1O14810 134 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 RPS6KB1P23443 525 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 LIMK1P53667 647 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 ARPP19P56211 112 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 PTGDRQ13258 359 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 GAS6Q14393 721 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 NAB2Q15742 525 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-210ENST00000578916 NPY5RQ15761 445 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms