RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570270.1

TAF1C-223, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit C, human

TSL 3

Gene TAF1C, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1C-223	ENST00000570270	CIT	O14578	2027 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	SPTLC2	O15270	562 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	PPP6R2	O75170	966 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	KIF4A	O95239	1232 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	YEATS4	O95619	227 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	PIGR	P01833	764 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	PAX3	P23760	479 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	STAT6	P42226	847 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	AMPD3	Q01432	767 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	GRIN1	Q05586	938 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	ALCAM	Q13740	583 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	POSTN	Q15063	836 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	UPP1	Q16831	310 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	LIN9	Q5TKA1	542 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	POMK	Q9H5K3	350 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	PIDD1	Q9HB75	910 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	CFAP45	Q9UL16	551 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TAF1C-223	ENST00000570270	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270		H7C4K7	107 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	SYN3	O14994	580 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	OGT	O15294	1046 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	CLCNKB	P51801	687 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	GTF2B	Q00403	316 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	BECN1	Q14457	450 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	SPECC1	Q5M775	1068 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	PALB2	Q86YC2	1186 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	CEP120	Q8N960	986 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	HASPIN	Q8TF76	798 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	RABGGTA	Q92696	567 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	DDX12P	Q92771	950 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	CUEDC2	Q9H467	287 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	TRIP11	Q15643	1979 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270		F8W810	466 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	PODXL	O00592	558 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	ABLIM1	O14639	778 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	TGM5	O43548	720 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	CYP3A5	P20815	502 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	FGFR3	P22607	806 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	ZXDA	P98168	799 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	UVSSA	Q2YD98	709 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	RTP2	Q5QGT7	225 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	APPL2	Q8NEU8	664 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	CLIC6	Q96NY7	704 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	CUTA	O60888	179 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	XYLB	O75191	536 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	PTPN21	Q16825	1174 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	LILRA6	Q6PI73	481 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	USP49	Q70CQ1	688 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	DYM	Q7RTS9	669 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	KIF12	Q96FN5	646 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	KCNH6	Q9H252	994 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	MTRR	Q9UBK8	725 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270		A0A0B4J269	797 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TAF1C-223	ENST00000570270	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		14.92	□□□□□ -0.02

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