RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	MEOX1	P50221	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SCNN1G	P51170	649 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	GABRE	P78334	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	RIN1	Q13671	783 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341		Q6ZRM9	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	IP6K1	Q92551	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	MST1R	Q04912	1400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	COL15A1	P39059	1388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SCD	O00767	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CYP27B1	O15528	508 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	BMP5	P22003	454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	GJB2	P29033	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ACAP1	Q15027	740 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	FEZ1	Q99689	392 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	APP	P05067	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	STAT3	P40763	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	TEF	Q10587	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	CRHR2	Q13324	411 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	KIF20A	O95235	890 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	ATP5J	P18859	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	KCNJ4	P48050	445 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	ADCY7	P51828	1080 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CFDP1-208	ENST00000569341	ADAM8	P78325	824 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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