RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 TRAPPC3O43617 180 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 PROZP22891 400 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 TDGQ13569 410 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 UPP1Q16831 310 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 BRAPQ7Z569 592 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 I3L4J1 428 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 ADAM12O43184 909 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 BMP15O95972 392 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 FGFR3P22607 806 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 OR1D2P34982 312 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 BRCC3P46736 316 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 PTPN5P54829 565 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 BICD1Q96G01 975 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 SNX27Q96L92 541 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 MYADMQ96S97 322 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 ABLIM1O14639 778 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 SLC26A4O43511 780 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 TOM1L1O75674 476 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 C8AP07357 584 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 SEZ6Q53EL9 994 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 ARSHQ5FYA8 562 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 XKR4Q5GH76 650 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 GPBP1Q86WP2 473 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 POLIQ9UNA4 740 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 H0YCG3 227 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 PODXLO00592 558 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 GRIN1Q05586 938 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 MTRRQ9UBK8 725 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 CCL16O15467 120 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 CLDN3O15551 220 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 FAM13AO94988 1023 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 PAPLNO95428 1278 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 KCNE1P15382 129 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 MRE11P49959 708 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 TCF15Q12870 199 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 CUL4AQ13619 759 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 RAB33AQ14088 237 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 MCM6Q14566 821 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 ZPBP2Q6X784 338 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 MYCT1Q8N699 235 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 REEP2Q9BRK0 252 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.264e-6■■■■□ 21.4
PPP4C-211ENST00000567642 CNTN3Q9P232 1028 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 PLCG1P19174 1290 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 PDCP20941 246 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 FSHRP23945 695 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 NCKAP1LP55160 1127 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 FLCNQ8NFG4 579 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 XYLBO75191 536 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 LAMP2P13473 410 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 NTHL1P78549 312 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC15Q8TF66 581 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 RAD54LQ92698 747 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.88■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 K7ENM7 598 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CFHP08603 1231 aa22.87■■□□□ 1.25
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