RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NR2F2P24468 414 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RPL13P26373 211 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR1G1P47890 313 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRRC63Q05C16 580 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPAG1Q07617 926 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRIN2CQ14957 1233 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 JADE1Q6IE81 842 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 Q7L0L9 218 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KLHL23Q8NBE8 558 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM161BQ96MY7 647 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DERAQ9Y315 318 aa26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 H3BNC9 293 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NRP1O14786 923 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 XPOTO43592 962 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALDH2P05091 517 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WNT7BP56706 349 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPM6BQ13491 265 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RDH13Q8NBN7 331 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NELFBQ8WX92 580 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UROC1Q96N76 676 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPG21Q9NZD8 308 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.03■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGF18O76093 207 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NFICP08651 508 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NLRP12P59046 1061 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PAK1Q13153 545 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM132DQ14C87 1099 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SURF1Q15526 300 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB6Q15916 424 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NT5DC4Q86YG4 428 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DEFB123Q8N688 67 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MLKLQ8NB16 471 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C2CD2Q9Y426 696 aa26.02■■□□□ 1.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITGB1P05556 798 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP3A5P20815 502 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CASP4P49662 377 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLCB3Q01970 1234 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP24A1Q07973 514 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADAM9Q13443 819 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CEP135Q66GS9 1140 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EFCAB13Q8IY85 973 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM169Q96HH4 297 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IGSF21Q96ID5 467 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDE11AQ9HCR9 933 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MARCH5Q9NX47 278 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa26.01■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SZT2Q5T011 3432 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BICDL2A1A5D9 508 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RFXAPO00287 272 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PSMD6Q15008 389 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DPCR1Q3MIW9 517 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BEST2Q8NFU1 509 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MFSD14AQ96MC6 490 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PAAF1Q9BRP4 392 aa26■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CETN3O15182 167 aa25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAPK13O15264 365 aa25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLCNKBP51801 687 aa25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KRT17Q04695 432 aa25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPATA1Q5VX52 437 aa25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTI2Q6NXR4 508 aa25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RABGGTAQ92696 567 aa25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DACH1Q9UI36 760 aa25.99■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PODXLO00592 558 aa25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRM6O15303 877 aa25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LPXNO60711 386 aa25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AKAP3O75969 853 aa25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRPAP1P30533 357 aa25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RPL9P32969 192 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STX17P56962 302 aa25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBE3AQ05086 875 aa25.98■■□□□ 1.75
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NFKBIBQ15653 356 aa25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms