RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 TNMDQ9H2S6 317 aa16.2■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 IRAK3Q9Y616 596 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.2■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.19■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 BRCC3P46736 316 aa16.19■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.19■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 CHST7Q9NS84 486 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 CNTN3Q9P232 1028 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.19■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 LACTBL1A8MY62 500 aa16.18■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 TEX28O15482 410 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 B3GAT3O94766 335 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 CLTAP09496 248 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNE1P15382 129 aa16.18■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 UPP1Q16831 310 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 USP41Q3LFD5 358 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 PALB2Q86YC2 1186 aa16.18■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 CASP10Q92851 521 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 C5orf42Q9H799 3197 aa16.17■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 TTPALQ9BTX7 342 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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RABGGTA-211ENST00000559850 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 ADAM12O43184 909 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 NFICP08651 508 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 CMA1P23946 247 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-211ENST00000559850 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
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