RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557694.1

LGMN-218, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 2

Gene LGMN, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-218ENST00000557694 VNN2O95498 520 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 CDR1P51861 262 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 EFNA5P52803 228 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 CUL4AQ13619 759 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 PTPAQ15257 358 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 HACE1Q8IYU2 909 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 FAM84AQ96KN4 292 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 REEP2Q9BRK0 252 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 ANK1P16157 1881 aa16.9■□□□□ 0.3
LGMN-218ENST00000557694 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 LAD1O00515 517 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ST18O60284 1047 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 TBC1D4O60343 1298 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SEC24AO95486 1093 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 PLS3P13797 630 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 PLCG1P19174 1290 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 FGF14Q92915 247 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 EPSTI1Q96J88 318 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ADPGKQ9BRR6 497 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 MTRRQ9UBK8 725 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.89■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 CARNS1A5YM72 827 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 LRRN2O75325 713 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 C8AP07357 584 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 CFHP08603 1231 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 CXCL8P10145 99 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 LAMP2P13473 410 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 WNT7BP56706 349 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 TDGQ13569 410 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 HTR4Q13639 388 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 RAB33AQ14088 237 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 PARM1Q6UWI2 310 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 CLIC6Q96NY7 704 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 CNTN3Q9P232 1028 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.88■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 A0A087X0B3 334 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 WDR27A2RRH5 827 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ANHXE9PGG2 379 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 H3BQV1 296 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 PODXLO00592 558 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 NR1I2O75469 434 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 MCF2P10911 925 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 KCNE1P15382 129 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 NCKAP1LP55160 1127 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 RESTQ13127 1097 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 GPBP1Q86WP2 473 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 GPR65Q8IYL9 337 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ING5Q8WYH8 240 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 NUMBLQ9Y6R0 609 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 NCANO14594 1321 aa16.87■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 CCR2P41597 374 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ROR1Q01973 937 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ZBTB6Q15916 424 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 SIX5Q8N196 739 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 FLCNQ8NFG4 579 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 GPR152Q8TDT2 470 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 TCEAL4Q96EI5 215 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 DRC1Q96MC2 740 aa16.86■□□□□ 0.29
LGMN-218ENST00000557694 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms