RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	CHAD	O15335	359 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ATG13	O75143	517 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	STAM2	O75886	525 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TLE1	Q04724	770 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC14A1	Q13336	389 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	NBR1	Q14596	966 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617		E9PAM4	449 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SKI	P12755	728 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ITGB5	P18084	799 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFV2	P19404	249 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	STAT5B	P51692	787 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	DSC1	Q08554	894 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF787	Q6DD87	383 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ANO7	Q6IWH7	933 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	DHRS13	Q6UX07	377 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SYT13	Q7L8C5	426 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RASSF3	Q86WH2	238 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	DEFB119	Q8N690	84 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ABCD4-222	ENST00000555617	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	POLR2M	P0CAP2	368 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP4A	P20648	1035 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	USP41	Q3LFD5	358 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC157	Q569K6	752 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	C11orf74	Q86VG3	221 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	METTL13	Q8N6R0	699 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	URGCP	Q8TCY9	931 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CORO1B	Q9BR76	489 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	AZI2	Q9H6S1	392 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IL21R	Q9HBE5	538 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MIOS	Q9NXC5	875 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	AK5	Q9Y6K8	562 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	AKAP9	Q99996	3911 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	KNL1	Q8NG31	2342 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TMPRSS3	P57727	454 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR65	Q8IYL9	337 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	FGF11	Q92914	225 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	KIF2C	Q99661	725 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	AMN	Q9BXJ7	453 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	STARD5	Q9NSY2	213 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SVIL	O95425	2214 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	BRINP1	O60477	761 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF623	O75123	536 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	P2RY2	P41231	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	GPC3	P51654	580 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ACTR2	P61160	394 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	APPBP2	Q92624	585 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	GAD1	Q99259	594 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCD4-222	ENST00000555617	RSAD1	Q9HA92	442 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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