RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 WDR27A2RRH5 827 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 TBX3O15119 743 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 AXIN1O15169 862 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 EXTL3O43909 919 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 TBC1D4O60343 1298 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ECI2O75521 394 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 RECQL4O94761 1208 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
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CTDSP2-208ENST00000552294 NLRP5P59047 1200 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 GRIK3Q13003 919 aa7.53□□□□□ -1.2
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CTDSP2-208ENST00000552294 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 BLIDQ8IZY5 108 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 RDM1Q8NG50 284 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SHDQ96IW2 340 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CORO1BQ9BR76 489 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 MTRRQ9UBK8 725 aa7.53□□□□□ -1.2
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CTDSP2-208ENST00000552294 ARID2Q68CP9 1835 aa7.52□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 ERLIN2O94905 339 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 PRKCBP05771 671 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 RETP07949 1114 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 RPS6KB1P23443 525 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 GNA11P29992 359 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 ARPP19P56211 112 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 CDC42EP1Q00587 391 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 ROR1Q01973 937 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 TNK2Q07912 1038 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 STK3Q13188 491 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 NR5A1Q13285 461 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 TUSC3Q13454 348 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 EPHA7Q15375 998 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 CSRP2Q16527 193 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.52□□□□□ -1.21
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CTDSP2-208ENST00000552294 TPH2Q8IWU9 490 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 C4orf19Q8IY42 314 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.52□□□□□ -1.21
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CTDSP2-208ENST00000552294 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.52□□□□□ -1.21
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CTDSP2-208ENST00000552294 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 GDAQ9Y2T3 454 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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CTDSP2-208ENST00000552294 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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CTDSP2-208ENST00000552294 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 LIG1P18858 919 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXA9P31269 272 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 RFC5P40937 340 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 RCAN1P53805 252 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 EVCP57679 992 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 AAMPQ13685 434 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 TEAD2Q15562 447 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP2-208ENST00000552294 ECM1Q16610 540 aa7.51□□□□□ -1.21
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