RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 ATL3Q6DD88 541 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 FBXL18Q96ME1 805 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TRIP11Q15643 1979 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 CLTAP09496 248 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 WEE2P0C1S8 567 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 CASP5P51878 434 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 GPR65Q8IYL9 337 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 DHX58Q96C10 678 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TTC26A0AVF1 554 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 B3GAT3O94766 335 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 GAP43P17677 238 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 ME1P48163 572 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 SPAG1Q07617 926 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 UROC1Q96N76 676 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TTPALQ9BTX7 342 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 I3L4J1 428 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 OGTO15294 1046 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 ADH1AP07327 375 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 MYBP10242 640 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 IDEP14735 1019 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 RESP18Q5W5W9 173 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 FNIP2Q9P278 1114 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 PODXLO00592 558 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ADAM12O43184 909 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 FGFR3P22607 806 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ADSSP30520 456 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 BRCC3P46736 316 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ITIH3Q06033 890 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CEP57Q86XR8 500 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.76■■□□□ 1.23
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CS-222ENST00000550996 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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CS-222ENST00000550996 TNMDQ9H2S6 317 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 POMKQ9H5K3 350 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PANK4Q9NVE7 773 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CFAP45Q9UL16 551 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 LACTBL1A8MY62 500 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 GLUD1P00367 558 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ADRB2P07550 413 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 SPATA31D3P0C874 917 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ABCD1P33897 745 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ZBTB6Q15916 424 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 LILRA6Q6PI73 481 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PALB2Q86YC2 1186 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 HPS3Q969F9 1004 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 HVCN1Q96D96 273 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CUEDC2Q9H467 287 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CITO14578 2027 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 TGM5O43548 720 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 GCNT3O95395 438 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 GUCY2FP51841 1108 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PSMD5Q16401 504 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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