RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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CTDSP2-204ENST00000548823 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 CACNA1GO43497 2377 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 EVPLQ92817 2033 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 TEX33O43247 280 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 LYPLA2O95372 231 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 GAP43P17677 238 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM14Q14142 442 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM228AQ86W67 206 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 TSG101Q99816 390 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1W2PQC6 194 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 EPCAMP16422 314 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 SDHBP21912 280 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP4A11Q02928 519 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR149Q86SP6 731 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 HPS3Q969F9 1004 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 IRAK3Q9Y616 596 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-204ENST00000548823 KRBA1A5PL33 1030 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 LGALS16A8MUM7 142 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TPM2P07951 284 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 SP9P0CG40 484 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 RFX1P22670 979 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 SFNP31947 248 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC26A2P50443 739 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TPH2Q8IWU9 490 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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CTDSP2-204ENST00000548823 DNM2P50570 870 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 JAK3P52333 1124 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ACTR2P61160 394 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 VPS52Q8N1B4 723 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TC2NQ8N9U0 490 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC51Q96ER9 411 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 PANX2Q96RD6 677 aa21.75■■□□□ 1.07
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CTDSP2-204ENST00000548823 REEP2Q9BRK0 252 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBP1Q9H171 429 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 VPS16Q9H269 839 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 CHMP2AO43633 222 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 HBP1O60381 514 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 CFHP08603 1231 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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CTDSP2-204ENST00000548823 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM169Q96HH4 297 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 SPTBN2O15020 2390 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 NFASCO94856 1347 aa21.74■■□□□ 1.07
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CTDSP2-204ENST00000548823 STX10O60499 249 aa21.74■■□□□ 1.07
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CTDSP2-204ENST00000548823 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 LXNQ9BS40 222 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 COL1A2P08123 1366 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 CCP110O43303 1012 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ATG7O95352 703 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 TPM1P09493 284 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 CTSAP10619 480 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 GUCY2CP25092 1073 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF131P52739 623 aa21.73■■□□□ 1.07
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