RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 LAMA4Q16363 1823 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PIK3R2O00459 728 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SOX9P48436 509 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ADCY1Q08828 1119 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 DUSP4Q13115 394 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SIX5Q8N196 739 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ITFG1Q8TB96 612 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CDT1Q9H211 546 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 INVSQ9Y283 1065 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PTGESO14684 152 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TGM5O43548 720 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 EFCAB14O75071 495 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CYP3A7P24462 503 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ARSHQ5FYA8 562 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TCP11Q8WWU5 503 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ACAP3Q96P50 834 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NUMA1Q14980 2115 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 LINC00271P0C7V0 271 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 LAG3P18627 525 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 HOXC8P31273 242 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SMTNP53814 917 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 WNT7BP56706 349 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 LRMPQ12912 555 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 LIN9Q5TKA1 542 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CEP135Q66GS9 1140 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 GALNT17Q6IS24 598 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MTMR6Q9Y217 621 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MYMKA6NI61 221 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 GLUD1P00367 558 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 C8AP07357 584 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TNNI1P19237 187 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 GPR15P49685 360 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NKX3-2P78367 333 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PGBD4Q96DM1 585 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CEP89Q96ST8 783 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 LACTBL1A8MY62 500 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CALCAP01258 141 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NFICP08651 508 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 STX17P56962 302 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 GPC5P78333 572 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 BIRC3Q13489 604 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MTMR3Q13615 1198 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PSMD5Q16401 504 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.21□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 GBP4Q96PP9 640 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 R4GN57 208 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SPTLC2O15270 562 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ATP2C2O75185 946 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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