RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 MYBP10242 640 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SURF1Q15526 300 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 LXNQ9BS40 222 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FAM153BP0C7A2 387 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 GHRP10912 638 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 CCNA1P78396 465 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FAM153CQ494X1 144 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 CNPY4Q8N129 248 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 F5H6K3 240 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 KLRC3Q07444 240 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 CNGA3Q16281 694 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 DPP9Q86TI2 863 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ZFATQ9P243 1243 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PSAPP07602 524 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 NBPF3Q9H094 633 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ORC6Q9Y5N6 252 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ACADSP16219 412 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ADA2Q9NZK5 511 aa20.46■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.45■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ACAP3Q96P50 834 aa20.45■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 WRNIP1Q96S55 665 aa20.45■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PPCSQ9HAB8 311 aa20.45■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.45■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 IGBP1P78318 339 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 CREG2Q8IUH2 290 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 SPC25Q9HBM1 224 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 PARVAQ9NVD7 372 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 HAO1Q9UJM8 370 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 UBE4BO95155 1302 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 A0A0U1RQJ8 604 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 RARGP13631 454 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 GJB7Q6PEY0 223 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 TLR10Q9BXR5 811 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 M0QZ92 97 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 CENPPQ6IPU0 288 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 FUKQ8N0W3 1084 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 NSL1Q96IY1 281 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.45■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 INTS13Q9NVM9 706 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 CYTH1Q15438 398 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 TRIP10Q15642 601 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 OSBPP22059 807 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 OCA2Q04671 838 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 C18orf8Q96DM3 657 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 SERPINB3P29508 390 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 JAK3P52333 1124 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 ROR1Q01973 937 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 MTMR1Q13613 665 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 RCN1Q15293 331 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 HIC2Q96JB3 615 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 THAP2Q9H0W7 228 aa20.44■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 F8VZ95 297 aa20.43■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 O00370 1275 aa20.43■□□□□ 0.86
SUDS3-204ENST00000543473 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms