RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MYBL1P10243 752 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 NEFHP12036 1026 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 POLD1P28340 1107 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MXI1P50539 228 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CCNG2Q16589 344 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 PDK4Q16654 411 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TRABD2AQ86V40 505 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TPH2Q8IWU9 490 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CYP4X1Q8N118 509 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 FAM13CQ8NE31 585 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 KIFAP3Q92845 792 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ERP27Q96DN0 273 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ACCSQ96QU6 501 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CHKBQ9Y259 395 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 LY75O60449 1722 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RASA4BC9J798 803 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 C6orf229H3BNL8 230 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RASA4O43374 803 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ECE2O60344 883 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 BBOX1O75936 387 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RAD23BP54727 409 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ENPEPQ07075 957 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 PPP3CAQ08209 521 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SLC45A4Q5BKX6 768 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 C10orf82Q8WW14 230 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 IWS1Q96ST2 819 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 COA1Q9GZY4 146 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PRG0 241 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CETPP11597 493 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ADRA2BP18089 450 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ATP4AP20648 1035 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 PTPN4P29074 926 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ADCY8P40145 1251 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ANO7Q6IWH7 933 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 IRGCQ6NXR0 463 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ZNF365Q70YC5 407 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MFN1Q8IWA4 741 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CHST7Q9NS84 486 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 K7ENM7 598 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 C2CD2LO14523 706 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 PSTPIP1O43586 416 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 GAS7O60861 476 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 CYP11B1P15538 503 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 CNGA1P29973 690 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 MAPK4P31152 587 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 PCK1P35558 622 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 DLG4P78352 724 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 KLC1Q07866 573 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 TMED2Q15363 201 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 KSR1Q8IVT5 923 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 WDR18Q9BV38 432 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 TIPINQ9BVW5 301 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-202ENST00000542324 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms