RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 KXD1Q9BQD3 176 aa26.4■■□□□ 1.82
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PTPRJ-205ENST00000527952 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRJ-205ENST00000527952 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRJ-205ENST00000527952 MTRRQ9UBK8 725 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRJ-205ENST00000527952 SIT1Q9Y3P8 196 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRJ-205ENST00000527952 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.39■■□□□ 1.82
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PTPRJ-205ENST00000527952 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-205ENST00000527952 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-205ENST00000527952 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB34Q9BZG1 259 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-205ENST00000527952 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-205ENST00000527952 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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