RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522926.1

TNIP1-216, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNIP1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-216ENST00000522926 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.24■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.24■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.24■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 MAGEA9P43362 315 aa20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 FAM187BQ17R55 369 aa20.23■□□□□ 0.83
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TNIP1-216ENST00000522926 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 GDAQ9Y2T3 454 aa20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 STK36Q9NRP7 1315 aa20.23■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 FRYQ5TBA9 3013 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 TXKP42681 527 aa20.22■□□□□ 0.83
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TNIP1-216ENST00000522926 GRM2Q14416 872 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 CALCRLQ16602 461 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 LPAL2Q16609 132 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 BORCS6Q96GS4 357 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 USP18Q9UMW8 372 aa20.22■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 N4BP3O15049 544 aa20.21■□□□□ 0.83
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TNIP1-216ENST00000522926 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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TNIP1-216ENST00000522926 BRCC3P46736 316 aa20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 ADCY1Q08828 1119 aa20.21■□□□□ 0.83
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TNIP1-216ENST00000522926 PDXDC1Q6P996 788 aa20.21■□□□□ 0.83
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TNIP1-216ENST00000522926 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 MTMR9Q96QG7 549 aa20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 POLD4Q9HCU8 107 aa20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 GDE1Q9NZC3 331 aa20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TNIP1-216ENST00000522926 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 B3GAT3O94766 335 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 PRKCBP05771 671 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 CCR2P41597 374 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 LMNB2Q03252 620 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 NELL2Q99435 816 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 LAMA1P25391 3075 aa20.2■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 TBC1D4O60343 1298 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 PFKFB2O60825 505 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 MED24O75448 989 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 CDKL5O76039 1030 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 XBP1P17861 261 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ATP2B1P20020 1258 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 KRT2P35908 639 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ARHGAP8P85298 464 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ROR1Q01973 937 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 UPP1Q16831 310 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 CHRDQ9H2X0 955 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 NCANO14594 1321 aa20.19■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 WDR27A2RRH5 827 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ACKR2O00590 384 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 NCAM2O15394 837 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 SEC24AO95486 1093 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
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TNIP1-216ENST00000522926 SPEM2Q0P670 501 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 CORO1BQ9BR76 489 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 RTKNQ9BST9 563 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 COL4A2P08572 1712 aa20.18■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 NEMFO60524 1076 aa20.17■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 ABLIM3O94929 683 aa20.17■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 MAPK6Q16659 721 aa20.17■□□□□ 0.82
TNIP1-216ENST00000522926 RTL10Q7L3V2 364 aa20.17■□□□□ 0.82
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