RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	IL13RA1	P78552	427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TBR1	Q16650	682 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	UGT8	Q16880	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	OPHN1	O60890	802 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DTNB	O60941	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	APOL3	O95236	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	LDHC	P07864	332 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	C5AR1	P21730	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CHKA	P35790	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	BCAR1	P56945	870 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CFHR4	Q92496	578 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RASA4B	C9J798	803 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RASA4	O43374	803 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	AGR2	O95994	175 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PEX11B	O96011	259 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SRGN	P10124	158 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MTHFD2	P13995	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPK9	P45984	424 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CCT5	P48643	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MRE11	P49959	708 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CRHR2	Q13324	411 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ELF2	Q15723	593 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP72	Q9P209	647 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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