RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF653Q96CK0 615 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 FAM81BQ96LP2 452 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM9Q9C026 710 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ARMT1Q9H993 441 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 LTBP1Q14766 1721 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CCDC160A6NGH7 325 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 EXOC3O60645 756 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 SPAG7O75391 227 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ACTN1P12814 892 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 PTPN4P29074 926 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 GPSM2P81274 684 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 NIM1KQ8IY84 436 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 STKLD1Q8NE28 680 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 GREM2Q9H772 168 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 GPR108Q9NPR9 543 aa8.7□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CES2O00748 559 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 MAPK13O15264 365 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ATP5HO75947 161 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CETPP11597 493 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 PTENP60484 403 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 FUT2Q10981 343 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ACVR2BQ13705 512 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 GPC2Q8N158 579 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 STMN2Q93045 179 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 EBF3Q9H4W6 596 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CEP72Q9P209 647 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 RTL9Q8NET4 1388 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 NDUFB5O43674 189 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ASMTLO95671 621 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 POTEJP0CG39 1038 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 NAT1P18440 290 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 VPS41P49754 854 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CCR3P51677 355 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 IGBP1P78318 339 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 UBE4AQ14139 1066 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 MAGEB18Q96M61 343 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TTC1Q99614 292 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CFAP69A5D8W1 941 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF862O60290 1169 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 BAG2O95816 211 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 HSPA6P17066 643 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TXKP42681 527 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ASIC2Q16515 512 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CENPPQ6IPU0 288 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 TREML1Q86YW5 311 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 GIPC2Q8TF65 315 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 ABHD8Q96I13 439 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 PWWP2AQ96N64 755 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 SMC6Q96SB8 1091 aa8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLVS1-204ENST00000518858 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms