RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 STON2Q8WXE9 905 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 BOD1Q96IK1 185 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCO1Q9HAY6 547 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNE5Q9UJ90 142 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ORC4O43929 436 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PEX1O43933 1283 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL2RBP14784 551 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC6A2P23975 617 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SP140Q13342 867 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 TKFCQ3LXA3 575 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF529Q6P280 563 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR156Q8NFN8 814 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 APPBP2Q92624 585 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAX2Q96IS3 184 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 LDAHQ9H6V9 325 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM74BQ9NUR3 256 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 FANCLQ9NW38 375 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCSHP23434 173 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDCD1Q15116 288 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP2A13Q16696 494 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP7Q93009 1102 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 NACC2Q96BF6 587 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPNE5Q9HCH3 593 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 LANCL2Q9NS86 450 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC78A2IDD5 438 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PROP1O75360 226 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS23O95084 383 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENPP1P22413 925 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH1A3P47895 512 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 VAV2P52735 878 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6ZVL8 140 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SSH3Q8TE77 659 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 UROC1Q96N76 676 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACAP3Q96P50 834 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PROB1E7EW31 1015 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 WNT10BO00744 389 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 CKBP12277 381 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPD1P21695 349 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SREBF1P36956 1147 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP10-9P60411 292 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 GEN1Q17RS7 908 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF366Q8N895 744 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 FATE1Q969F0 183 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 MFSD3Q96ES6 412 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF778Q96MU6 729 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM140Q9NV12 185 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR91A4D1P6 747 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 YY2O15391 372 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC45O75419 566 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALAS1P13196 640 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTGFP29279 349 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOMO1Q15155 1222 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 KAZNQ674X7 775 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 LNX2Q8N448 690 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms