RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	PER2	O15055	1255 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CSPG5	O95196	566 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	AOC1	P19801	751 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MUT	P22033	750 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KCNC3	Q14003	757 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NR1I3	Q14994	352 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KRT31	Q15323	416 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LRRC43	Q8N309	656 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF558	Q96NG5	402 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	REEP2	Q9BRK0	252 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LXN	Q9BS40	222 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SPG21	Q9NZD8	308 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	COL1A2	P08123	1366 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TCHH	Q07283	1943 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	EVPL	Q92817	2033 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TEX33	O43247	280 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	HBP1	O60381	514 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ATP9A	O75110	1047 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CCNE2	O96020	404 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	INSRR	P14616	1297 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	STAT5B	P51692	787 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CDC42EP1	Q00587	391 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SP4	Q02446	784 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TDG	Q13569	410 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CENPP	Q6IPU0	288 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SFR1	Q86XK3	245 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TSG101	Q99816	390 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ADAM2	Q99965	735 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SAMM50	Q9Y512	469 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF292	O60281	2723 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NFASC	O94856	1347 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	WDR64	B1ANS9	1081 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	N4BP3	O15049	544 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ZBTB39	O15060	712 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KIF20A	O95235	890 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	EOMES	O95936	686 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SKI	P12755	728 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SKIL	P12757	684 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KCNA2	P16389	499 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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