RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CCDC103Q8IW40 242 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GBP4Q96PP9 640 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ALG1Q9BT22 464 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PNMA2Q9UL42 364 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 JAK2O60674 1132 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PDHBP11177 359 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PTMSP20962 102 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SYT1P21579 422 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CALML3P27482 149 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GUCY1A2P33402 732 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GPR85P60893 370 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SP3Q02447 781 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZNF543Q08ER8 600 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 FAM160B2Q86V87 743 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PHKBQ93100 1093 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SCLYQ96I15 445 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 VCPKMTQ9H867 229 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PLA2G6O60733 806 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CTDNEP1O95476 244 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 NDUFB10O96000 172 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SNHG28P0DPA3 235 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SCG2P13521 617 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 IGFALSP35858 605 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 STAT3P40763 770 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 STAT2P52630 851 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 BACE1P56817 501 aa8.28□□□□□ -1.08
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HERC3-210ENST00000512194 ST3GAL1Q11201 340 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 BNIP3Q12983 259 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DUSP4Q13115 394 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 MCTP1Q6DN14 999 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GALNT17Q6IS24 598 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZPBP2Q6X784 338 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DTX1Q86Y01 620 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ERO1BQ86YB8 467 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 AHI1Q8N157 1196 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 FEM1BQ9UK73 627 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PTPRFP10586 1907 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 TMEM232C9JQI7 657 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CXCL11O14625 94 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CRTAMO95727 393 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CD8BP10966 210 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CTGFP29279 349 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 GNA11P29992 359 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 DDIT3P35638 169 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 FLT3P36888 993 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 GTF2A2P52657 109 aa8.27□□□□□ -1.09
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