RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0YCG3	227 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014		K7ENM7	598 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN3	O15551	220 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGM5	O43548	720 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFPL2	O75678	378 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLUD1	P00367	558 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1R	P00736	705 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADH1A	P07327	375 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADRB2	P07550	413 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYB	P10242	640 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALAD	P13716	330 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL9A1	P20849	921 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGFR3	P22607	806 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFSF9	P41273	254 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTHFR	P42898	656 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRCC3	P46736	316 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	E2F4	Q16254	413 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX12P	Q92771	950 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0B4J269	797 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014		I3L4J1	428 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPTLC2	O15270	562 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP6R2	O75170	966 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	B3GAT3	O94766	335 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	F13A1	P00488	732 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXCL8	P10145	99 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK38	Q15208	465 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	UROC1	Q96N76	676 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANK1	P16157	1881 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PODXL	O00592	558 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	YEATS4	O95619	227 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLTA	P09496	248 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCP2	P22307	547 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIG4	P49917	911 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPAG1	Q07617	926 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNA1	Q09470	495 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMD5	Q16401	504 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDA	Q92838	391 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	BICD1	Q96G01	975 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	OGT	O15294	1046 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19

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