RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF410	Q86VK4	478 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	DCLK2	Q8N568	766 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PHKB	Q93100	1093 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	RSAD1	Q9HA92	442 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	NRP1	O14786	923 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	RFPL2	O75678	378 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	POMC	P01189	267 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SOD2	P04179	222 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	FGFR3	P22607	806 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	XKR3	Q5GH77	459 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SVOP	Q8N4V2	548 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	BICD2	Q8TD16	824 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SHD	Q96IW2	340 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	MYADM	Q96S97	322 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ESYT2	A0FGR8	921 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX28	O15482	410 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF623	O75123	536 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	DDHD2	O94830	711 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA31D3	P0C874	917 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM157B	P0CG42	384 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SDHB	P21912	280 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GLUD2	P49448	558 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PALB2	Q86YC2	1186 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	KSR1	Q8IVT5	923 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	RIT2	Q99578	217 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	BCO2	Q9BYV7	579 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM150B	A6NC51	233 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	MSH4	O15457	936 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMTOR5	O43504	91 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALT3	O60512	393 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC27	P30260	824 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CIITA	P33076	1130 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.1	□□□□□ -0.47	2e-6	■■■■■ 149.1
SKAP2-209	ENST00000497511	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1B	Q00975	2339 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF292	O60281	2723 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT37	O76014	449 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP4	P12644	408 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMP2	P13473	410 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA4	P13612	1032 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	WEE1	P30291	646 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TNP2	Q05952	138 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	NECTIN1	Q15223	517 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		12.09	□□□□□ -0.47

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