RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493792.1

TRAPPC12-222, Transcript of trafficking protein particle complex 12, human

TSL 2

Gene TRAPPC12, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	S1PR5	Q9H228	398 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LZTS1	Q9Y250	596 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CACNA1A	O00555	2505 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PRR23A	A6NEV1	266 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FSCN2	O14926	492 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	INPPL1	O15357	1258 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MYB	P10242	640 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PROZ	P22891	400 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NBL1	P41271	181 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NDUFA8	P51970	172 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GTF2B	Q00403	316 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KCNC3	Q14003	757 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ACCS	Q96QU6	501 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FIZ1	Q96SL8	496 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TLE6	Q9H808	572 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A1W2PQ27	194 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A1W2PQ64	194 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A1W2PQD8	194 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FSD2	A1L4K1	749 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TISP43	B9A030	160 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ABLIM1	O14639	778 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PTGES	O14684	152 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PER2	O15055	1255 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TADA2A	O75478	443 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CXCL14	O95715	111 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MCL1	Q07820	350 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DSC1	Q08554	894 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TUSC3	Q13454	348 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ALCAM	Q13740	583 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HASPIN	Q8TF76	798 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HVCN1	Q96D96	273 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	USP25	Q9UHP3	1055 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792		F8W810	466 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C2CD2L	O14523	706 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OGT	O15294	1046 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PIGR	P01833	764 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CLTA	P09496	248 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CXCL8	P10145	99 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TNFSF9	P41273	254 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CASP5	P51878	434 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPAG1	Q07617	926 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KCNA1	Q09470	495 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CUL4B	Q13620	913 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KYAT1	Q16773	422 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DUSP6	Q16828	381 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	UNC13D	Q70J99	1090 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		11.34	□□□□□ -0.59

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