RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 BORCS6Q96GS4 357 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 NACC1Q96RE7 527 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 COL4A2P08572 1712 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A087WWV3 80 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 H3BQV1 296 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 LAD1O00515 517 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF623O75123 536 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ERLIN2O94905 339 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 AXLP30530 894 aa7.11□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 ARL2P36404 184 aa7.11□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 PTGDRQ13258 359 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CAPSQ13938 189 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PDIA5Q14554 519 aa7.11□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 IGSF21Q96ID5 467 aa7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.11□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.1□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ATMQ13315 3056 aa7.09□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 C2CD2LO14523 706 aa7.09□□□□□ -1.27
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