RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481314.5

HCLS1-207, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-207ENST00000481314 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 COL4A2P08572 1712 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 K7ESF4 209 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 B4GALT5O43286 388 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 KCNK5O95279 499 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 LRG1P02750 347 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PSMC3P17980 439 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 LRRC32Q14392 662 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 CORO1BQ9BR76 489 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 MTRRQ9UBK8 725 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ARID2Q68CP9 1835 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ZNF197O14709 1029 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 THP07101 528 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ZNF806P0C7X5 589 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ELF1P32519 619 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PTGDRQ13258 359 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PPP2R5CQ13362 524 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 VITQ6UXI7 678 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 C4orf19Q8IY42 314 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ASB16Q96NS5 453 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 LXNQ9BS40 222 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 VAV3Q9UKW4 847 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 IGF2RP11717 2491 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 A0A1B0GUA9 196 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PTGESO14684 152 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ZNF263O14978 683 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ZBTB39O15060 712 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 FGFR3P22607 806 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 POU5F1BQ06416 359 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 CAPSQ13938 189 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 SKAP1Q86WV1 359 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 SNTG2Q9NY99 539 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 RGL1Q9NZL6 768 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 WDR27A2RRH5 827 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PRRG1O14668 218 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 SLC37A4O43826 429 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 VIPR2P41587 438 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 EPHA7Q15375 998 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 Q6ZS52 159 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 Q6ZUG5 572 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 RASEFQ8IZ41 740 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 SMARCD2Q92925 531 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 DYDC2Q96IM9 177 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-207ENST00000481314 MICAL2O94851 1124 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 EPN2O95208 641 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 HOXC13P31276 330 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 CCR2P41597 374 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 FOXC1Q12948 553 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 KRT32Q14532 448 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 NTRK3Q16288 839 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 BRF1Q92994 677 aa14.89□□□□□ -0.03
HCLS1-207ENST00000481314 MSANTD3Q96H12 275 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms