RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476941.5

TRPC1-203, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 3,061 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-203ENST00000476941 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 PARP2Q9UGN5 583 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 BRAFP15056 766 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 ACADSP16219 412 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 MPP2Q14168 576 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 PARP6Q2NL67 630 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 ALG3Q92685 438 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 NACC1Q96RE7 527 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 PTGIRP43119 386 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 STK33Q9BYT3 514 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 FOCADQ5VW36 1801 aa20.39■□□□□ 0.86
TRPC1-203ENST00000476941 PHF2O75151 1096 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ENTPD5O75356 428 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 HSPA1LP34931 641 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 RFFLQ8WZ73 363 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 KAT5Q92993 513 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 BORCS6Q96GS4 357 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 EMSYQ7Z589 1322 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 DGKZQ13574 1117 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 KIFAP3Q92845 792 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 INTUQ9ULD6 942 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 NENFQ9UMX5 172 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CYP3A4P08684 503 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 EPHB2P29323 1055 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PADI6Q6TGC4 694 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 LDHDQ86WU2 507 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 FGD4Q96M96 766 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 YDJCA8MPS7 323 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 LMNB1P20700 586 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CHRNA3P32297 505 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TNIP1Q15025 636 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 MTFR1Q15390 333 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TTC27Q6P3X3 843 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PRELID2Q8N945 189 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PHC3Q8NDX5 983 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 FIZ1Q96SL8 496 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SCOCQ9UIL1 159 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PODXLO00592 558 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 BFSP1Q12934 665 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 COG5Q9UP83 839 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 LGR5O75473 907 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ATP5DP30049 168 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 MESDQ14696 234 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 IL31RAQ8NI17 732 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 SLC5A5Q92911 643 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 FAM84AQ96KN4 292 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 TBK1Q9UHD2 729 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 ATP5HO75947 161 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 MARCKSL1P49006 195 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 RCN2Q14257 317 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC6Q16204 474 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-203ENST00000476941 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms