RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
GINS1-202ENST00000473460 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4.72□□□□□ -1.65
GINS1-202ENST00000473460 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.72□□□□□ -1.65
GINS1-202ENST00000473460 USP25Q9UHP3 1055 aa4.72□□□□□ -1.65
GINS1-202ENST00000473460 ENPP1P22413 925 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 GUCY1A2P33402 732 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 PROK1P58294 105 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 EPHA10Q5JZY3 1008 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 MFSD3Q96ES6 412 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 CASS4Q9NQ75 786 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 RNF7Q9UBF6 113 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 KCNE5Q9UJ90 142 aa4.71□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 A0A087X0B3 334 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 PROP1O75360 226 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 GPANK1O95872 356 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ALDH1A3P47895 512 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ID4P47928 161 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 LNX2Q8N448 690 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 WIPF3A6NGB9 483 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 POMCP01189 267 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 RAP2AP10114 183 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 FPR1P21462 350 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ECHS1P30084 290 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 VAV2P52735 878 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 PPP3CAQ08209 521 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ADRM1Q16186 407 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 CMIPQ8IY22 773 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 STON2Q8WXE9 905 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 RAX2Q96IS3 184 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ACAP3Q96P50 834 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 FEZ1Q99689 392 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 MYOCQ99972 504 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 IL17RBQ9NRM6 502 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ASB6Q9NWX5 421 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 PLAAQ9Y263 795 aa4.69□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ATP5JP18859 108 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 LDAHQ9H6V9 325 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 NEMP1O14524 444 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 CKBP12277 381 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 IL2RBP14784 551 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ABCG1P45844 678 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 GEN1Q17RS7 908 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 MUM1Q2TAK8 710 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ZNF529Q6P280 563 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 KCNK18Q7Z418 384 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 Q8NA96 180 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SSH3Q8TE77 659 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 LANCL2Q9NS86 450 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 PDE8AO60658 829 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 CDC45O75419 566 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 PCSK1P29120 753 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SLC6A9P48067 706 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SESN3P58005 492 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 NOMO3P69849 1222 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 SEPT2Q15019 361 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 NOMO1Q15155 1222 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 DHCR24Q15392 516 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-202ENST00000473460 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms