RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451997.5

SH3BP1-203, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 3,123 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-203ENST00000451997 FMO1Q01740 532 aa13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP1-203ENST00000451997 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 GSTA5Q7RTV2 222 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP1-203ENST00000451997 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 A0A0G2JND7 137 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 F5H6K3 240 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 GCAP28676 217 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 MAGEA4P43358 317 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 34.6
SH3BP1-203ENST00000451997 CCDC6Q16204 474 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 SLC30A9Q6PML9 568 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 CROCCP2Q86T23 111 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-203ENST00000451997 MBOAT7Q96N66 472 aa13.42□□□□□ -0.26
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