RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DERAQ9Y315 318 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IPPQ9Y573 584 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HLA-DRAP01903 254 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SKIP12755 728 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 APBA1Q02410 837 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TLE2Q04725 743 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRMPQ12912 555 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DSC3Q14574 896 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WDR44Q5JSH3 913 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 JADE1Q6IE81 842 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDXDC1Q6P996 788 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RRAGAQ7L523 313 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BAP1Q92560 729 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SEMA4DQ92854 862 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SNX27Q96L92 541 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 APOL6Q9BWW8 343 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMX1Q9H3N1 280 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PARP2Q9UGN5 583 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYO6Q9UM54 1294 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C2CD2Q9Y426 696 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HES2Q9Y543 173 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RECQL4O94761 1208 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NFICP08651 508 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SKILP12757 684 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITGA4P13612 1032 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCZ1BP86790 482 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAAP100Q0VG06 881 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MBTPS1Q14703 1052 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF12Q96FN5 646 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM81BQ96LP2 452 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NT5C1BQ96P26 610 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPAG5Q96R06 1193 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HIPK3Q9H422 1215 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRC53A6NM62 1247 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MGEA5O60502 916 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF623O75123 536 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VNN1O95497 513 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FECHP22830 423 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AKAP5P24588 427 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRPC3Q13507 836 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCOA4Q13772 614 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IQCEQ6IPM2 695 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM84AQ96KN4 292 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADAM2Q99965 735 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STK33Q9BYT3 514 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CNTN3Q9P232 1028 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCN5AQ14524 2016 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A0U1RQF3 1178 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 XPOTO43592 962 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNE1P15382 129 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MFAP3P55082 362 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MEA1Q16626 185 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 XKR4Q5GH76 650 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GJB7Q6PEY0 223 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM139Q8IV31 216 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PGBD4Q96DM1 585 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RNF39Q9H2S5 420 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RGS18Q9NS28 235 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms