RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP161Q6P656 301 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NSMFQ6X4W1 530 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AFG1LQ8WV93 481 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RUBCNQ92622 972 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFRSF25Q93038 417 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HAUS7Q99871 368 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARMT1Q9H993 441 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBP1Q9NZI7 540 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP25Q9UHP3 1055 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OIP5O43482 229 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHGBP05060 677 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RB1P06400 928 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF286BP0CG31 522 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CPB1P15086 417 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOX5P35711 763 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEK3P51956 506 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFKB2Q00653 900 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTX1Q13505 466 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UVSSAQ2YD98 709 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TM4SF20Q53R12 229 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IQCEQ6IPM2 695 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM35AQ86V20 835 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACDQ96AP0 544 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLD4Q96BZ4 506 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFSD3Q96ES6 412 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM87BQ96K49 555 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC17Q96LX7 622 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALG1Q9BT22 464 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAD50Q92878 1312 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKAP13Q12802 2813 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KAT6AQ92794 2004 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EMSYQ7Z589 1322 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFIBO00712 420 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIP5K1CO60331 668 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RHOBTB3O94955 611 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSPH10BP0C881 870 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOSL1P15407 271 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TYRP1P17643 537 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BMP6P22004 513 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMA3P25788 255 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THPOP40225 353 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GUCY2FP51841 1108 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDE4BQ07343 736 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOBRQ0VD83 1088 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BIRC3Q13489 604 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PERM1Q5SV97 790 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C12orf60Q5U649 245 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POF1BQ8WVV4 589 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NKD1Q969G9 470 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAM19Q9H013 955 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 S1PR5Q9H228 398 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FEM1BQ9UK73 627 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOX13Q9UN79 622 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IPPQ9Y573 584 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms