RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.27□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GFPT2O94808 682 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SERPING1P05155 500 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CKBP12277 381 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SKIP12755 728 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FERP16591 822 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TNFAIP3P21580 790 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RFX1P22670 979 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AKAP5P24588 427 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CD52P31358 61 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SOX5P35711 763 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CDK7P50613 346 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WNT7BP56706 349 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CLDN10P78369 228 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RBP5P82980 135 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MGAT3Q09327 533 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NCOA4Q13772 614 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPA17Q15506 151 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZACNQ401N2 412 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 JADE1Q6IE81 842 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 VPS36Q86VN1 386 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP38Q8NB14 1042 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RNF169Q8NCN4 708 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BEST2Q8NFU1 509 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LMO3Q8TAP4 145 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CAGE1Q8TC20 777 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BAP1Q92560 729 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PGBD4Q96DM1 585 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF333Q96JL9 665 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM84AQ96KN4 292 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DNAJC7Q99615 494 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DPP3Q9NY33 737 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KLK14Q9P0G3 267 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PADI3Q9ULW8 664 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYO6Q9UM54 1294 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HES2Q9Y543 173 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SQORQ9Y6N5 450 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 UTRNP46939 3433 aa7.26□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SIP14410 1827 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM189A1O60320 539 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LRRN2O75325 713 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RECQL4O94761 1208 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 VNN1O95497 513 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NFICP08651 508 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRT5P13647 590 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SELPP16109 830 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYL6P60660 151 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRT83P78385 493 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CDK17Q00537 523 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LPIN1Q14693 890 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 UBXN11Q5T124 520 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WDR59Q6PJI9 974 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIAA1328Q86T90 577 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TAF4BQ92750 862 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.25□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARMC5Q96C12 935 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms