RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-204	ENST00000438490	EBAG9	O00559	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DGAT1	O75907	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCNE2	O96020	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FGG	P02679	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PSAP	P07602	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MPST	P25325	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	HSD3B2	P26439	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ICAM3	P32942	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	COG5	Q9UP83	839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RLF	Q13129	1914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	VWA5A	O00534	786 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ITGA4	P13612	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MAN1A1	P33908	653 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC1A1	P43005	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NPTX2	P47972	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GCLM	P48507	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SEC13	P55735	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PEX3	P56589	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DLG4	P78352	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DR1	Q01658	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FMO1	Q01740	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PTGIS	Q16647	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	UGCG	Q16739	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC16A4	O15374	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TTI1	O43156	1089 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DAPK3	O43293	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SGPL1	O95470	568 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NR3C2	P08235	984 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	KCNA2	P16389	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ADSS	P30520	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CDR1	P51861	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RAB15	P59190	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DRP2	Q13474	957 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PSMD6	Q15008	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	JAML	Q86YT9	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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