RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430889.2

HOXC4-202, Transcript of homeobox C4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC4, Length 1,666 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4-202ENST00000430889 GRM1Q13255 1194 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 TTMPQ5BVD1 217 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 IER5Q5VY09 327 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 FNBP1Q96RU3 617 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 UTRNP46939 3433 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 HSPA6P17066 643 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 PIK3CAP42336 1068 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 GUCY2FP51841 1108 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 CENPCQ03188 943 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 MESDQ14696 234 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 CYP1B1Q16678 543 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 AADACL2Q6P093 401 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 ARL8AQ96BM9 186 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC4-202ENST00000430889 PLXNB2O15031 1838 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 FAM187AA6NFU0 413 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 ERICH4A6NGS2 130 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 H0YGN5 161 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PGK2P07205 417 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 CLTAP09496 248 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 KRT5P13647 590 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 TNNI1P19237 187 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PTGIRP43119 386 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 EFNA5P52803 228 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 BPIFB4P59827 614 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PPFIA1Q13136 1202 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 CUL2Q13617 745 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 WDR44Q5JSH3 913 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 DUPD1Q68J44 220 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PRELID2Q8N945 189 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 BTBD6Q96KE9 485 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 NFS1Q9Y697 457 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 EVPLQ92817 2033 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 CCDC66A2RUB6 948 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 DAPK3O43293 454 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PHF2O75151 1096 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PYGMP11217 842 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PROZP22891 400 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 ACTN2P35609 894 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 GJA5P36382 358 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF132P52740 706 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PLCB4Q15147 1175 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 CFAP58Q5T655 872 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 EMC10Q5UCC4 262 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 NAA35Q5VZE5 725 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 MON1BQ7L1V2 547 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 SPON1Q9HCB6 807 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 TOM1L1O75674 476 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 MYBL1P10243 752 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 MCL1Q07820 350 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 TRIM50Q86XT4 487 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 TCP11Q8WWU5 503 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 OPTNQ96CV9 577 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms