RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.94□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYH11P35749 1972 aa11.94□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARL5CA6NH57 179 aa11.93□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 TGM5O43548 720 aa11.93□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 TFDP1Q14186 410 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC39A14Q15043 492 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.57e-19■□□□□ 10.7
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APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.93□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.93□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa11.92□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 KIFAP3Q92845 792 aa11.91□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 ZFP42Q96MM3 310 aa11.91□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 POLD4Q9HCU8 107 aa11.91□□□□□ -0.5
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APOBEC3C-202ENST00000428892 PARP2Q9UGN5 583 aa11.91□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.91□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 HES2Q9Y543 173 aa11.91□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.91□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 VWA8A3KMH1 1905 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPTLC1O15269 473 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 B4GALT5O43286 388 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC3C-202ENST00000428892 YEATS4O95619 227 aa11.9□□□□□ -0.5
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