RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NDUFA8P51970 172 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EHHADHQ08426 723 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UPP1Q16831 310 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA0319Q5VV43 1072 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LLGL2Q6P1M3 1020 aa27.25■■□□□ 1.95
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNC13DQ70J99 1090 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP57L1Q8IYX8 460 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.24■■□□□ 1.95
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa27.24■■□□□ 1.95
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRXCR2A6NFK2 248 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADRB2P07550 413 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNPP09543 421 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXD13P35453 343 aa27.23■■□□□ 1.95
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KYAT1Q16773 422 aa27.23■■□□□ 1.95
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 C3orf58Q8NDZ4 430 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UROC1Q96N76 676 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLHL5Q96PQ7 755 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC38A7Q9NVC3 462 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTC28Q96AY4 2481 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FSD2A1L4K1 749 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LACTBL1A8MY62 500 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 URODP06132 367 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IL9P15248 144 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACOT2P49753 483 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FSIP1Q8NA03 581 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD207Q9UJ71 328 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 B3GAT3O94766 335 aa27.21■■□□□ 1.95
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP41Q3LFD5 358 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTP2Q5QGT7 225 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC22A17Q8WUG5 538 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POMGNT1Q8WZA1 660 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RXFP1Q9HBX9 757 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP25Q9UHP3 1055 aa27.21■■□□□ 1.95
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLRC4O43908 158 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP2R3AQ06190 1150 aa27.2■■□□□ 1.94
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM26FQ5R3K3 315 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM171A1Q5VUB5 890 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD54Q6NXT1 300 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMRP1Q8NCR6 262 aa27.2■■□□□ 1.94
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX28O15482 410 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPCAMP16422 314 aa27.19■■□□□ 1.94
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA1841Q6NSI8 718 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYCE2Q6PIF2 218 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYCP3Q8IZU3 236 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF12Q96FN5 646 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM206Q9H813 350 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CITO14578 2027 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C5orf42Q9H799 3197 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CUL9Q8IWT3 2517 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLCN4P51793 760 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POSTNQ15063 836 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR65Q8IYL9 337 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF507Q8TCN5 953 aa27.18■■□□□ 1.94
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