RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 PTENP60484 403 aa21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 BIRC3Q13489 604 aa21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF653Q96CK0 615 aa21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 VTA1Q9NP79 307 aa21.63■■□□□ 1.05
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SUMO3-204ENST00000411651 NUP85Q9BW27 656 aa21.63■■□□□ 1.05
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SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.62■■□□□ 1.05
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SUMO3-204ENST00000411651 FZD8Q9H461 694 aa21.62■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.62■■□□□ 1.05
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SUMO3-204ENST00000411651 STRNO43815 780 aa21.61■■□□□ 1.05
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SUMO3-204ENST00000411651 PEX5P50542 639 aa21.61■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.61■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.61■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.61■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 RNF149Q8NC42 400 aa21.61■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 ALG3Q92685 438 aa21.61■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 ACP6Q9NPH0 428 aa21.61■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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SUMO3-204ENST00000411651 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.61■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.61■■□□□ 1.05
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SUMO3-204ENST00000411651 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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SUMO3-204ENST00000411651 FAM187BQ17R55 369 aa21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM50Q86XT4 487 aa21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 PLVAPQ9BX97 442 aa21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 RAB17Q9H0T7 212 aa21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.59■■□□□ 1.05
SUMO3-204ENST00000411651 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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