RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410678.1

RNU6-402P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 402, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-402P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-402P-201ENST00000410678 PHACTR3Q96KR7 559 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 IER2Q9BTL4 223 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 ADM5C9JUS6 153 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 KCNK3O14649 394 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 DNAJB5O75953 348 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 URI1O94763 535 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 TTLL1O95922 423 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PRLP01236 227 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 NGFRP08138 427 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 GRIA2P42262 883 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 RRP1P56182 461 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PDE4CQ08493 712 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 NFATC4Q14934 902 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CATSPEREQ5SY80 951 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 C10orf25Q5T742 122 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CEP85Q6P2H3 762 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PELI3Q8N2H9 469 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 FBXO41Q8TF61 875 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 ZNF479Q96JC4 524 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PGBD1Q96JS3 809 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CAMK1GQ96NX5 476 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 EGLN1Q9GZT9 426 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 MLXIPQ9HAP2 919 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 WDR17Q8IZU2 1322 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 FAM83GA6ND36 823 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 SMIM22K7EJ46 135 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 LDLRP01130 860 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 TNFRSF8P28908 595 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCT8P50990 548 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 HSD11B2P80365 405 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 TMEM132BQ14DG7 1078 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 TXNRD1Q16881 649 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 TM4SF20Q53R12 229 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PDXDC1Q6P996 788 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 NOSTRINQ8IVI9 506 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CUL5Q93034 780 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 MAML3Q96JK9 1138 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 C5orf34Q96MH7 638 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PDGFCQ9NRA1 345 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 SH3BP4Q9P0V3 963 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 A0A0A6YYJ9 748 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 AGRPO00253 132 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 LDB3O75112 727 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PYGMP11217 842 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 KRT5P13647 590 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PLA2G2AP14555 144 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PPP2R2AP63151 447 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 GEN1Q17RS7 908 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 FAM47CQ5HY64 1035 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CAMKK1Q8N5S9 505 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 C8orf58Q8NAV2 365 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PIK3C3Q8NEB9 887 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 DLG3Q92796 817 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 EXOC2Q96KP1 924 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 FAM118BQ9BPY3 351 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 ANO3Q9BYT9 981 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 CDCP1Q9H5V8 836 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 SNED1Q8TER0 1413 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-402P-201ENST00000410678 PJA2O43164 708 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 HIP1RO75146 1068 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 TULP3O75386 442 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 FNTBP49356 437 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 KEAP1Q14145 624 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 NTRK3Q16288 839 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 TTC38Q5R3I4 469 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 COLCA1Q6ZS62 124 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 MED25Q71SY5 747 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 SPAG16Q8N0X2 631 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCDC82Q8N4S0 544 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 PCDH19Q8TAB3 1148 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 SPATA32Q96LK8 384 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 A0A0B4J293 547 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-402P-201ENST00000410678 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms