RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CENPTQ96BT3 561 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZNF653Q96CK0 615 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SAAL1Q96ER3 474 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PGM2Q96G03 612 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 IFT74Q96LB3 600 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 GRHL1Q9NZI5 618 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZNF862O60290 1169 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PMS2P54278 862 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TADA2BQ86TJ2 420 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 BSNDQ8WZ55 320 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 GLG1Q92896 1179 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ATG4CQ96DT6 458 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 LRRC19Q9H756 370 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 STYXL1Q9Y6J8 313 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 RLFQ13129 1914 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 C19orf81C9J6K1 198 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SPOPO43791 374 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 HMGCS2P54868 508 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 MOGSQ13724 837 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SLMAPQ14BN4 828 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 WNK4Q96J92 1243 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CCT8L2Q96SF2 557 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.46■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 EXTL3O43909 919 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PYGMP11217 842 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 DSG3P32926 999 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 COILP38432 576 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SLC1A1P43005 524 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PPIL2Q13356 520 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 KRT71Q3SY84 523 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.45■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 FSCN2O14926 492 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 HTRA3P83110 453 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 PSMD6Q15008 389 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 XKR3Q5GH77 459 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 C18orf8Q96DM3 657 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.45■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 GMNCA6NCL1 334 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TRAPPC3O43617 180 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 PIGRP01833 764 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 UNGP13051 313 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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PMS1-205ENST00000409985 APLP1P51693 650 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 GNPTABQ3T906 1256 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SPRYD7Q5W111 196 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.44■■□□□ 1.66
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PMS1-205ENST00000409985 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 CENPHQ9H3R5 247 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 RIPK3Q9Y572 518 aa25.44■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 MYPNQ86TC9 1320 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.43■■□□□ 1.66
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PMS1-205ENST00000409985 DENND2CQ68D51 928 aa25.43■■□□□ 1.66
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PMS1-205ENST00000409985 TRIM31Q9BZY9 425 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 C1orf112Q9NSG2 853 aa25.43■■□□□ 1.66
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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PMS1-205ENST00000409985 SNX24Q9Y343 169 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 PLTPP55058 493 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 RGMBQ6NW40 437 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TTC27Q6P3X3 843 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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