RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 STAT5BP51692 787 aa22.59■■□□□ 1.21
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ANKRD28-201ENST00000399451 NR1I3Q14994 352 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 ST8SIA6P61647 398 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 MAPRE2Q15555 327 aa22.58■■□□□ 1.21
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ANKRD28-201ENST00000399451 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD28-201ENST00000399451 HPS3Q969F9 1004 aa22.58■■□□□ 1.21
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ANKRD28-201ENST00000399451 TEKT4Q8WW24 435 aa22.57■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.56■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.56■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 SMIM5Q71RC9 77 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 PRRG1O14668 218 aa22.55■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 GH1P01241 217 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 SREBF2Q12772 1141 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 P3H1Q32P28 736 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 CEP55Q53EZ4 464 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 GGA3Q9NZ52 723 aa22.55■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 HIC1Q14526 733 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.55■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 RGL1Q9NZL6 768 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 SUFUQ9UMX1 484 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 RNF135Q8IUD6 432 aa22.54■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 C19orf81C9J6K1 198 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 RARBP10826 455 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 PGM1P36871 562 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 TEX12Q9BXU0 123 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
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