RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396667.7

TMEM106B-201, Transcript of transmembrane protein 106B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM106B, Length 12,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106B-201ENST00000396667 CPED1A4D0V7 1026 aa4.71□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 RHOCP08134 193 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMEM106B-201ENST00000396667 KYAT1Q16773 422 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMEM106B-201ENST00000396667 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.71□□□□□ -1.66
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TMEM106B-201ENST00000396667 KDM1AO60341 852 aa4.7□□□□□ -1.66
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